Theo đó, chủ lô hàng thuộc diện phải kiểm dịch ngoài việc thực hiện thủ tục hải quan theo quy định hiện hành và thông quan hàng hóa theo hướng dẫn còn phải có trách nhiệm bảo quản nguyên trạng hàng hóa đối với lô hàng, đưa về địa điểm kiểm dịch ngoài địa bàn quản lý hải quan để thực hiện yêu cầu về kiểm dịch. Sau đó, chủ lô hàng phải nộp giấy chứng nhận kiểm dịch cho cơ quan hải quan để hoàn thành thủ tục thông quan hàng hóa theo đúng thời hạn quy định; thực hiện quyết định xử lý của cơ quan có thẩm quyền đối với các hành vi vi phạm pháp luật có liên quan đến thủ tục kiểm dịch và thủ tục hải quan.

Cơ quan hải quan có trách nhiệm theo dõi hồ sơ các lô hàng, giao cho chủ hàng mang về bảo quản chờ kết quả kiểm dịch. Trước 5 ngày hết hạn nộp giấy chứng nhận kiểm dịch, cơ quan hải quan phải có văn bản thông báo chủ hàng đến nộp giấy chứng nhận kiểm dịch để hoàn thành việc thông quan hàng hóa. Khi chủ hàng có vi phạm quy định về nộp giấy chứng nhận kiểm dịch hoặc hàng hóa không đáp ứng yêu cầu kiểm dịch, cơ quan hải quan phải căn cứ những quy định hiện hành để xử lý.

Thông tư có hiệu lực từ ngày 15/2/2012.