Theo cáo trạng của Viện KSND, từ tháng 8-2012 đến hết tháng 5-2013, các bị can: Vương Thị Kim Thành, Nguyễn Thị Ngà, Nguyễn Thị Thu Trang, Nguyễn Thị Hồng Nhung, Vương Thị Lan, Nguyễn Đồng Sơn, Nguyễn Thị Xuyên (là Trưởng khoa và Kỹ thuật viên Khoa Xét nghiệm) đã lợi dụng chức vụ, quyền hạn thực hiện xét nghiệm huyết học không đúng quy định, gây thiệt hại cho Bảo hiểm xã hội huyện Hoài Đức - Bảo hiểm xã hội thành phố hơn 16,5 triệu đồng. Mặc dù thiệt hại vật chất không lớn nhưng cơ quan tố tụng cho rằng, hành vi của các bị can gây ảnh hưởng lớn đến uy tín, đạo đức nghề nghiệp; gây hoài nghi và giảm lòng tin của nhân dân; gây dư luận xấu.

Nguyên Giám đốc Nguyễn Trí Liêm và nguyên Phó Giám đốc Bệnh viện Nguyễn Thị Nhiên bị đề nghị truy tố tội "Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng" vì trong quá trình thực hiện nhiệm vụ đã buông lỏng quản lý, không thực hiện hết chức trách, nhiệm vụ được giao; không phát hiện ra những sai phạm có hệ thống, diễn ra trong thời gian dài... Trong vụ án, cơ quan tố tụng quyết định không xem xét, xử lý hình sự với một số cán bộ của bệnh viện, do không biết việc in trước kết quả xét nghiệm, không hưởng lợi hoặc có vi phạm nhưng đã chủ động tố cáo, hợp tác tích cực với cơ quan điều tra.